Abstract: La malattia di Stargardt (STGD1) è una retinopatia autosomica recessiva, causata da mutazioni nel gene del trasportatore legante ATP (ABCA4) specifico della retina. Per stabilire lo spettro mutazionale e per valutare gli effetti di varianti genetiche comuni e introniche profonde selezionate sulla malattia, abbiamo eseguito un'analisi di sequenza completa in un'ampia coorte di pazienti tedeschi STGD1. Campioni di DNA di 335 pazienti con STGD1 sono stati analizzati per mutazioni ABCA4 ne ...; [Read more...]
La malattia di Stargardt (STGD1) è una retinopatia autosomica recessiva, causata da mutazioni nel gene del trasportatore legante ATP (ABCA4) specifico della retina. Per stabilire lo spettro mutazionale e per valutare gli effetti di varianti genetiche comuni e introniche profonde selezionate sulla malattia, abbiamo eseguito un'analisi di sequenza completa in un'ampia coorte di pazienti tedeschi STGD1. Campioni di DNA di 335 pazienti con STGD1 sono stati analizzati per mutazioni ABCA4 nei suoi 50 esoni codificanti e sequenze introniche adiacenti mediante tecnologia di risequenziamento dell'array o sequenziamento di nuova generazione (NGS). Un test in vitro è stato utilizzato per testare varianti selezionate per il loro comportamento di splicing. La nostra analisi ha identificato 148 mutazioni patogene o probabili patogene, di cui 48 costituiscono alleli della malattia associati ad ABCA4 finora non pubblicati. Quattro rare varianti introniche profonde sono state trovate una volta in 472 alleli analizzati. Inoltre, abbiamo identificato sei varianti comuni che modulano il rischio. Le stime del punteggio di rischio genetico suggeriscono che le varianti ABCA4 comuni definite influenzano il rischio di malattia nei portatori di un singolo allele ABCA4 patogeno. Il nostro studio si aggiunge allo spettro mutazionale del gene ABCA4. Inoltre, nella nostra coorte, le varianti introniche profonde nell'introne 30 e 36 probabilmente non giocano o giocano solo un ruolo minore nella patologia della malattia. Da notare, i nostri risultati dimostrano un possibile effetto modificante di varianti di sequenza comuni sulla malattia associata ad ABCA4.
